Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB6BQ9NRW1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB6BQ9NRW1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms