Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLE3Q9NRF9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms