Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CYLDQ9NQC7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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