Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD15

SRA1, Steroid receptor RNA activator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRA1Q9HD15 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SRA1Q9HD15 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRA1Q9HD15 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRA1Q9HD15 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRA1Q9HD15 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRA1Q9HD15 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRA1Q9HD15 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRA1Q9HD15 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRA1Q9HD15 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRA1Q9HD15 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SRA1Q9HD15 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRA1Q9HD15 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRA1Q9HD15 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRA1Q9HD15 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRA1Q9HD15 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRA1Q9HD15 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRA1Q9HD15 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRA1Q9HD15 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRA1Q9HD15 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRA1Q9HD15 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRA1Q9HD15 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRA1Q9HD15 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRA1Q9HD15 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRA1Q9HD15 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRA1Q9HD15 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SRA1Q9HD15 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRA1Q9HD15 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRA1Q9HD15 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRA1Q9HD15 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SRA1Q9HD15 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRA1Q9HD15 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SRA1Q9HD15 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRA1Q9HD15 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRA1Q9HD15 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRA1Q9HD15 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRA1Q9HD15 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRA1Q9HD15 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRA1Q9HD15 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRA1Q9HD15 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms