Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNRC6CQ9HCJ0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms