Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CBX8Q9HC52 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBX8Q9HC52 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms