Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UPF2Q9HAU5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UPF2Q9HAU5 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UPF2Q9HAU5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UPF2Q9HAU5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UPF2Q9HAU5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPF2Q9HAU5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPF2Q9HAU5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPF2Q9HAU5 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPF2Q9HAU5 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPF2Q9HAU5 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPF2Q9HAU5 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPF2Q9HAU5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPF2Q9HAU5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPF2Q9HAU5 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPF2Q9HAU5 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
UPF2Q9HAU5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPF2Q9HAU5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPF2Q9HAU5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
UPF2Q9HAU5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPF2Q9HAU5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPF2Q9HAU5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
UPF2Q9HAU5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
UPF2Q9HAU5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPF2Q9HAU5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPF2Q9HAU5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPF2Q9HAU5 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPF2Q9HAU5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPF2Q9HAU5 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPF2Q9HAU5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPF2Q9HAU5 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPF2Q9HAU5 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPF2Q9HAU5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPF2Q9HAU5 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPF2Q9HAU5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPF2Q9HAU5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPF2Q9HAU5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UPF2Q9HAU5 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UPF2Q9HAU5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UPF2Q9HAU5 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UPF2Q9HAU5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UPF2Q9HAU5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UPF2Q9HAU5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UPF2Q9HAU5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms