Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4P4

RNF41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF41Q9H4P4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF41Q9H4P4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF41Q9H4P4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF41Q9H4P4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF41Q9H4P4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF41Q9H4P4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF41Q9H4P4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF41Q9H4P4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF41Q9H4P4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF41Q9H4P4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF41Q9H4P4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF41Q9H4P4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF41Q9H4P4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF41Q9H4P4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF41Q9H4P4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF41Q9H4P4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF41Q9H4P4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF41Q9H4P4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF41Q9H4P4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF41Q9H4P4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF41Q9H4P4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF41Q9H4P4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF41Q9H4P4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF41Q9H4P4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF41Q9H4P4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF41Q9H4P4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF41Q9H4P4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF41Q9H4P4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF41Q9H4P4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF41Q9H4P4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF41Q9H4P4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF41Q9H4P4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF41Q9H4P4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF41Q9H4P4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF41Q9H4P4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF41Q9H4P4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF41Q9H4P4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF41Q9H4P4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF41Q9H4P4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF41Q9H4P4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF41Q9H4P4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF41Q9H4P4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF41Q9H4P4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF41Q9H4P4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF41Q9H4P4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF41Q9H4P4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF41Q9H4P4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF41Q9H4P4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF41Q9H4P4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF41Q9H4P4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF41Q9H4P4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF41Q9H4P4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF41Q9H4P4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms