Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD1Q9GZZ0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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HOXD1Q9GZZ0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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