Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTMR12Q9C0I1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms