Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP44Q9C0F1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms