Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms