Protein–RNA interactions for Protein: Q9C056

NKX6-2, Homeobox protein Nkx-6.2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX6-2Q9C056 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX6-2Q9C056 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms