Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SCAPERQ9BY12 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SCAPERQ9BY12 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms