Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms