Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFT27Q9BW83 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT27Q9BW83 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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