Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C9orf16Q9BUW7 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms