Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRACR2AQ9BSW2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRACR2AQ9BSW2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms