Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms