Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BPIFA3Q9BQP9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms