Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POP1Q99575 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POP1Q99575 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POP1Q99575 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POP1Q99575 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POP1Q99575 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POP1Q99575 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POP1Q99575 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POP1Q99575 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POP1Q99575 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POP1Q99575 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POP1Q99575 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POP1Q99575 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
POP1Q99575 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POP1Q99575 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POP1Q99575 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POP1Q99575 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POP1Q99575 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POP1Q99575 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POP1Q99575 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POP1Q99575 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POP1Q99575 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POP1Q99575 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
POP1Q99575 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POP1Q99575 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POP1Q99575 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POP1Q99575 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POP1Q99575 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POP1Q99575 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POP1Q99575 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POP1Q99575 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POP1Q99575 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POP1Q99575 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POP1Q99575 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POP1Q99575 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POP1Q99575 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
POP1Q99575 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POP1Q99575 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POP1Q99575 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POP1Q99575 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POP1Q99575 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POP1Q99575 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POP1Q99575 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POP1Q99575 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POP1Q99575 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POP1Q99575 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POP1Q99575 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POP1Q99575 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
POP1Q99575 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POP1Q99575 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POP1Q99575 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POP1Q99575 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POP1Q99575 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POP1Q99575 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POP1Q99575 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POP1Q99575 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POP1Q99575 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POP1Q99575 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POP1Q99575 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
POP1Q99575 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
POP1Q99575 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
POP1Q99575 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POP1Q99575 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POP1Q99575 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POP1Q99575 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POP1Q99575 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POP1Q99575 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POP1Q99575 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POP1Q99575 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POP1Q99575 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POP1Q99575 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POP1Q99575 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POP1Q99575 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POP1Q99575 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POP1Q99575 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POP1Q99575 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
POP1Q99575 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POP1Q99575 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POP1Q99575 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POP1Q99575 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POP1Q99575 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POP1Q99575 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POP1Q99575 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POP1Q99575 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POP1Q99575 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POP1Q99575 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POP1Q99575 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POP1Q99575 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POP1Q99575 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POP1Q99575 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POP1Q99575 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POP1Q99575 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POP1Q99575 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POP1Q99575 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POP1Q99575 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POP1Q99575 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POP1Q99575 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POP1Q99575 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POP1Q99575 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
POP1Q99575 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms