Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAT1Q99536 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAT1Q99536 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms