Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC4A9Q96Q91 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms