Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC9Q96Q05 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms