Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PGBD1Q96JS3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGBD1Q96JS3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms