Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIC2Q96JB3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms