Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCC12Q96J65 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCC12Q96J65 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCC12Q96J65 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCC12Q96J65 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCC12Q96J65 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCC12Q96J65 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCC12Q96J65 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCC12Q96J65 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCC12Q96J65 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCC12Q96J65 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCC12Q96J65 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCC12Q96J65 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCC12Q96J65 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCC12Q96J65 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCC12Q96J65 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCC12Q96J65 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCC12Q96J65 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCC12Q96J65 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCC12Q96J65 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCC12Q96J65 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCC12Q96J65 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCC12Q96J65 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCC12Q96J65 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms