Protein–RNA interactions for Protein: Q96E40

SPACA9, Sperm acrosome-associated protein 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA9Q96E40 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPACA9Q96E40 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPACA9Q96E40 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPACA9Q96E40 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPACA9Q96E40 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPACA9Q96E40 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPACA9Q96E40 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SPACA9Q96E40 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPACA9Q96E40 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPACA9Q96E40 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPACA9Q96E40 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPACA9Q96E40 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPACA9Q96E40 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms