Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM8

ACSF2, Acyl-CoA synthetase family member 2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSF2Q96CM8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSF2Q96CM8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms