Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKD1Q969G9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms