Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNPO1Q92973 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNPO1Q92973 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms