Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNRQ92752 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNRQ92752 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNRQ92752 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNRQ92752 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNRQ92752 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNRQ92752 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNRQ92752 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNRQ92752 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNRQ92752 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNRQ92752 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNRQ92752 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNRQ92752 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TNRQ92752 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TNRQ92752 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNRQ92752 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNRQ92752 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNRQ92752 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNRQ92752 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNRQ92752 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNRQ92752 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNRQ92752 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNRQ92752 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNRQ92752 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNRQ92752 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNRQ92752 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNRQ92752 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNRQ92752 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNRQ92752 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TNRQ92752 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TNRQ92752 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNRQ92752 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TNRQ92752 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNRQ92752 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNRQ92752 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNRQ92752 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNRQ92752 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNRQ92752 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNRQ92752 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNRQ92752 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNRQ92752 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNRQ92752 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNRQ92752 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNRQ92752 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TNRQ92752 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNRQ92752 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNRQ92752 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNRQ92752 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNRQ92752 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNRQ92752 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNRQ92752 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNRQ92752 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNRQ92752 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNRQ92752 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNRQ92752 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNRQ92752 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNRQ92752 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TNRQ92752 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNRQ92752 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TNRQ92752 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TNRQ92752 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TNRQ92752 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNRQ92752 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TNRQ92752 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TNRQ92752 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNRQ92752 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNRQ92752 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNRQ92752 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TNRQ92752 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNRQ92752 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNRQ92752 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNRQ92752 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNRQ92752 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNRQ92752 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNRQ92752 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNRQ92752 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNRQ92752 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNRQ92752 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
TNRQ92752 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
TNRQ92752 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNRQ92752 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNRQ92752 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
TNRQ92752 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNRQ92752 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNRQ92752 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNRQ92752 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNRQ92752 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNRQ92752 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNRQ92752 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNRQ92752 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNRQ92752 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNRQ92752 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNRQ92752 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNRQ92752 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNRQ92752 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNRQ92752 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
TNRQ92752 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNRQ92752 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
TNRQ92752 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNRQ92752 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms