Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ19

KCTD13, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD13Q8WZ19 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCTD13Q8WZ19 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms