Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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COPS9Q8WXC6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
COPS9Q8WXC6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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COPS9Q8WXC6 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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COPS9Q8WXC6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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COPS9Q8WXC6 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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