Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMO7Q8WWI1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMO7Q8WWI1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms