Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC107Q8WV48 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms