Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD2

SP7, Transcription factor Sp7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP7Q8TDD2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 AL109935.1-201ENST00000413249 473 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SP7Q8TDD2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SP7Q8TDD2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SP7Q8TDD2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SP7Q8TDD2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SP7Q8TDD2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SP7Q8TDD2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SP7Q8TDD2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SP7Q8TDD2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SP7Q8TDD2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SP7Q8TDD2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SP7Q8TDD2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SP7Q8TDD2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SP7Q8TDD2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SP7Q8TDD2 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SP7Q8TDD2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SP7Q8TDD2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SP7Q8TDD2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SP7Q8TDD2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SP7Q8TDD2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SP7Q8TDD2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SP7Q8TDD2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SP7Q8TDD2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SP7Q8TDD2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SP7Q8TDD2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms