Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDX54Q8TDD1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX54Q8TDD1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms