Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO3Q8TAP4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO3Q8TAP4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO3Q8TAP4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO3Q8TAP4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO3Q8TAP4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO3Q8TAP4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO3Q8TAP4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO3Q8TAP4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO3Q8TAP4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO3Q8TAP4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO3Q8TAP4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO3Q8TAP4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO3Q8TAP4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO3Q8TAP4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO3Q8TAP4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO3Q8TAP4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO3Q8TAP4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO3Q8TAP4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO3Q8TAP4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMO3Q8TAP4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMO3Q8TAP4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMO3Q8TAP4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMO3Q8TAP4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMO3Q8TAP4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LMO3Q8TAP4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMO3Q8TAP4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMO3Q8TAP4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LMO3Q8TAP4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMO3Q8TAP4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMO3Q8TAP4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMO3Q8TAP4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMO3Q8TAP4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMO3Q8TAP4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMO3Q8TAP4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMO3Q8TAP4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMO3Q8TAP4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMO3Q8TAP4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMO3Q8TAP4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMO3Q8TAP4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMO3Q8TAP4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LMO3Q8TAP4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMO3Q8TAP4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMO3Q8TAP4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMO3Q8TAP4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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