Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACBD4Q8NC06 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms