Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN7

RDH13, Retinol dehydrogenase 13, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13Q8NBN7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RDH13Q8NBN7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
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