Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAB2

KBTBD3, Kelch repeat and BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KBTBD3Q8NAB2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KBTBD3Q8NAB2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KBTBD3Q8NAB2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KBTBD3Q8NAB2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KBTBD3Q8NAB2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KBTBD3Q8NAB2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KBTBD3Q8NAB2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KBTBD3Q8NAB2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KBTBD3Q8NAB2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KBTBD3Q8NAB2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KBTBD3Q8NAB2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KBTBD3Q8NAB2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KBTBD3Q8NAB2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KBTBD3Q8NAB2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KBTBD3Q8NAB2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KBTBD3Q8NAB2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KBTBD3Q8NAB2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KBTBD3Q8NAB2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KBTBD3Q8NAB2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KBTBD3Q8NAB2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KBTBD3Q8NAB2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KBTBD3Q8NAB2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KBTBD3Q8NAB2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
KBTBD3Q8NAB2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KBTBD3Q8NAB2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KBTBD3Q8NAB2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KBTBD3Q8NAB2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms