Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G4

LRRC47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC47Q8N1G4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC47Q8N1G4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC47Q8N1G4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC47Q8N1G4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC47Q8N1G4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC47Q8N1G4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC47Q8N1G4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC47Q8N1G4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC47Q8N1G4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC47Q8N1G4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC47Q8N1G4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC47Q8N1G4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC47Q8N1G4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC47Q8N1G4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC47Q8N1G4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC47Q8N1G4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC47Q8N1G4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC47Q8N1G4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC47Q8N1G4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC47Q8N1G4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC47Q8N1G4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC47Q8N1G4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC47Q8N1G4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC47Q8N1G4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC47Q8N1G4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC47Q8N1G4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC47Q8N1G4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC47Q8N1G4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC47Q8N1G4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms