Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPAP2Q8IXW5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms