Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU1

IGDCC3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC3Q8IVU1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGDCC3Q8IVU1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms