Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z569

BRAP, BRCA1-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAPQ7Z569 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRAPQ7Z569 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms