Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDZD4Q76G19 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDZD4Q76G19 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDZD4Q76G19 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PDZD4Q76G19 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PDZD4Q76G19 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDZD4Q76G19 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDZD4Q76G19 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDZD4Q76G19 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDZD4Q76G19 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PDZD4Q76G19 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDZD4Q76G19 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDZD4Q76G19 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDZD4Q76G19 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDZD4Q76G19 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDZD4Q76G19 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PDZD4Q76G19 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDZD4Q76G19 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDZD4Q76G19 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDZD4Q76G19 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDZD4Q76G19 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDZD4Q76G19 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDZD4Q76G19 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDZD4Q76G19 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDZD4Q76G19 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDZD4Q76G19 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDZD4Q76G19 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDZD4Q76G19 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDZD4Q76G19 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDZD4Q76G19 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDZD4Q76G19 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDZD4Q76G19 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDZD4Q76G19 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDZD4Q76G19 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDZD4Q76G19 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PDZD4Q76G19 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PDZD4Q76G19 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDZD4Q76G19 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDZD4Q76G19 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDZD4Q76G19 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDZD4Q76G19 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms