Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

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Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPGS1Q6ZTW0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPGS1Q6ZTW0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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