Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LRIG3Q6UXM1 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRIG3Q6UXM1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms