Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCO3Q6UWJ1 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO3Q6UWJ1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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